La funzionalità del Master PDF Editor è molto ricca. Consente agli utenti di convertire un file PDF in una varietà di formati diversi, incluso HTML e XFA. Oltre a generare documenti, l'applicazione consente inoltre ai suoi utenti di modificare, firmare e aggiungere annotazioni ai documenti PDF. Le funzionalità multi-causa di questo software lo rendono un editor di documenti all-in-one. A parte l'abilitazione della modifica dei documenti PDF, consente inoltre agli utenti di osservarli.
L'editor principale PDF ha un'interfaccia utente semplice con una barra degli strumenti contenente un numero di strumenti, incluso un pulsante Redo. Il programma supporta anche più file contemporaneamente e ha un'opzione di segnalibri che consente agli utenti di creare un timbro personalizzato. Altre caratteristiche del programma includono la possibilità di inserire immagini e testo e supporta sia Mac OS che PC Windows. Un'altra caratteristica dell'applicazione è la possibilità di utilizzare la crittografia e la crittografia dei file PDF.
Oltre a creare documenti PDF, Master PDF Editor consente inoltre agli utenti di modificare immagini e forme. Il software fornisce anche strumenti per l'esportazione di file PDF in altri formati e unire diversi documenti PDF. Inoltre, gli utenti possono creare e firmare file PDF. La versione completa del software ha una varietà di altri strumenti, che lo rende un'applicazione multiuso. I principali vantaggi del programma sono: può facilmente modificare immagini e testi, aggiungere piè di pagina e annotazioni e convertire XPS in PDF.